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Raiz
Armillaria mellea
Agente causante:
Hongo parásito
Incidencia en Gipuzkoa:
Alta
Daños que causa:
Graves
Zonas afectadas:
Raices
     Es bastante común esta grave enfermedad en árboles que se encuentra en terrenos compactos, pesados y húmedos y en áreas de plantaciones jóvenes que con anterioridad tuvieron aprovechamiento forestal.
Los manzanos afectados presentan una vegetación débil, lánguida, mal color del follage y una fructificación deficiente.
Los únicos medios para combatir esta enfermedad son preventivos y consisten en drenar los terrenos y evitar el exceso de humedad.

Cuello
Phytophthora cactorum
Agente causante:
Hongo parásito
Incidencia en Gipuzkoa:
Baja
Daños que causa:
Graves
Zonas afectadas:
Cuello del tronco
     Es una grave enfermedad de la que tenemos constancia en Gipuzkoa, que puede provocar la muerte del árbol por destrucción de los conductos de la savia a nivel del cuello.
En la parte aérea suele apreciarse una reducción del crecimiento, frutos más pequeños, más coloreados y con maduración defectuosa, enrojecimiento prematuro del follaje y caida anticipada de las hojas.
Una medida preventiva de esta enfermedad es no enterrar la zona del injerto en el momento de la plantación, ya que en la mayoría de los casos por ese punto penetra el hongo.